一般的にどのプロスポーツでも
怪我したからと言って基本年俸が支払われないと言う事は無いと思います
出場試合数等に応じた出来高等は当然影響が出ると思います
Bリーグの規定では報酬の支払い時期は契約書に明記が必須です

双方合意の契約解除についても、報酬は一切もらいませんよりも、チームが違約金を支払って契約解除と言うケースが多い気はします(契約は契約ですから解除する義務はありません)
ちなみにこの違約金もサラリーキャップの対象です

IL入りの代替選手の補強については
その選手のIL入りの期間内かつ、離脱中の年俸の範囲で契約が可能です
(10ヶ月間で一億の契約の選手が6ヶ月ILした場合、最大6ヶ月6000万円の追加選手の契約が可能)

この追加選手の契約金や基本年俸、出来高などが結果的にサラリーキャップ8億を越えた場合
越えた分の100%を罰金としてリーグに支払う事で、降格等の処分を回避出来ます。
仮にキャップギリギリの状態から追加選手の補強が発生した場合は、その選手の本来の価値の倍の金銭的負担が必要になってしまいます